在二戰後的二十年裡（40~60年代），農田曾經過度噴灑農藥汙染了地下水與農地，甚至造成病蟲抗藥性，讓問題變得棘手更難以防治。
關於青蔥的栽種，農夫在不同季節要對抗不同的疫病問題：
全年無休：甜菜夜蛾
冬天到隔年春天：黑腐病、露菌病、銹病
夏天到秋天：炭疽病、軟腐病、薊馬、蟎類等病蟲危害。
天候異常之下，青蔥市場價格飆漲與假冒產地風波
在面臨耕種計畫趕不上氣候變化的時代，如何避免農作物損失、增高作物的抗候性與抗病性，同時降低農藥的使用量，是所有農民面臨的挑戰。
近年來，蔥田在大陸幾個偏北靠海的省份，有擴大耕地面積的情況，並且收穫滿滿。不過，台灣、日本與韓國的青蔥發展卻與大趨勢同步，都面臨從業人口老化以及後繼無人的情況，再加上農業耕作面積逐漸縮少與酷暑與豪雨影響，常常導致農作物歉收。
怕雨又怕熱的青蔥屢屢受到颱風減損產量，讓一般零售價格在50~120元/斤之間的台灣青蔥，在2024年11月以及2025年8月瞬間飆漲超過300元/斤以上。數倍價差的魅力讓貿易商想趁機賺高額價差鋌而走險，因而興起「進口中國蔥，假冒本地蔥」的風波：
- 2026年6月日本九條蔥：酷暑造成日本國內葉蔥的短缺，為了滿足市場需求，日本當地商人進口大陸蔥假冒京都「京都府產九條蔥」，企圖大發魚目混珠與機會財雙重利益，東窗事發之後，被以觸犯《不正競爭防止法》接受調查。
- 2024年4月台灣冷凍蔥：台灣食品公司從大陸進口1900箱的冷凍青蔥，假冒台灣青蔥名目販售，被依「行使業務登載不實文書罪」判處6月徒刑以及罰金20萬元。
- 2025年9月進口日本蔥：台灣也自日本進口蔥款，因農藥殘留超標（不合格）而遭邊境攔截退運。
台灣蔥農在天公不作美農作物歉收導致收入減少時，只能乾望進口商大發時機財；看到蔥價好，農夫一窩蜂地努力種蔥，想搭上價差順風車時，市場上一時湧進過量的蔥，反而造成蔥價跌落。農夫在歉收與豐收之間，吃力不討好。
面臨兩難的窘境之下，蔥農需要的政府單位自市場蒐集可靠的情報，預知該撒多少青蔥洋蔥種子、還是改種別的作物供應市場需求並且保障穩定的收益。
再者，還需要強化青蔥體質、降低農藥使用量，免於上架後因為農藥殘留過高面臨下架、銷毀的命運。關於這一點，就讓我們先了解一下，為何青蔥會有過高的農藥殘留。
為什麼青蔥農藥殘留居高不下？三大先天與種植困境
在農委會歷年公布的「蔬果農藥殘留清單」中，青蔥常常榜上有名。蔥農之所以會噴灑過多農藥，與青蔥本質上容易蟲蛀害病、青蔥的型態讓農藥不易附著以及密集耕種的方式有關：
容易疫病的體質：蔥一年四季皆適合栽種，不過致命傷就是對病蟲害的抵抗力比較低，尤其當夏天秋天遇到多雨及排水不良的環境，容易變成病蟲害的溫床。因此蔥農需要噴灑農藥，避免青蔥枯死、黑腐潰爛失去商品價值。
青蔥的型態：根根力爭向上，以及蔥葉表面的蠟質好比荷葉的疏水性質，二者加乘讓農藥滑落不容易附著。
圖片來源：Wikipedia/荷葉效應
集約耕地：耕地密集的栽種，混齡將成長期與採收期的蔥種得很靠近，造成噴灑農藥時，有些農藥無可避免地擴散到還不需要農藥的青蔥區塊，因此造成部分的青蔥吸收過多的農藥。
因此，當氣象預報要提早為強風豪雨做準備時，蔥農就會趕緊下田提早採收青蔥，以免辛苦種植的農作物付諸流水。
這些被提早採收的青蔥，有些可能農藥還未代謝完全就被摘起，未經過藥物檢驗專家採樣化驗，就送交盤商甚至上架，就有可能發生農藥殘留的情況。
除非是有機栽培的青蔥，否則不論是購買台灣蔥、大陸蔥或者日本蔥，都會農藥殘留的問題，即使市場缺蔥，只要進口蔥的農藥殘留過高，還是會被攔在關外的情況。
為了保障消費者食用安全、蔥農農作物收成與降低使用農藥之間取得進展，目前蔥田有以下三種因應方式：「智能防災設施農業」、產銷履歷認證、IPM作物病蟲害管理。
青蔥的栽培容易受到季節影響，一旦生長期乾旱、收成期過到雨水就會造成嚴重危害，為了克服天候不利因素，保障青蔥產量，2017年起農糧署推動「智能防災設施農業」，也就是溫室栽培結合智能環境監控設備，補助農民設置溫室，相較露天種植，溫室栽培預估可以減少40-60%風災損失，民間現已設置智能溫室的規格如下：
智能防災設施農業（溫室栽培）
- 防蟲網布：使用目2 mm x 2mm可抵抗11級輕度颱風強度（根據#浦福風級，當風力來到「10級以上」，會吹落盆栽、折斷樹枝與電線桿、戶外活動危險，人無法撐傘順利行走。如同2026年7月巴威颱風來襲之際的風勢。）如此可用以聯想網布的抗風能力。
- 結構棚架：最多人使用錏管棚架搭配壓條，內部骨架連結補強，若搭配自動開闔將能提供更好的屏蔽效果。
- 智能監控設備：智能環境監控設備，讓蔥農能即時掌握溫室內環境溫濕度與作物生長情況。
宜蘭三星蔥業者經驗：使用結構抗風網（業者反映擋風效果可達70%），搭配H型鋼，所有鋼材與零件使用不鏽鋼，底座防鏽處。溫室智能設備通常搭配無毒農業或有機栽培。
無毒農業的市場溢價優勢
農糧署除了推動「智能防災設施農業」，打造合適作物環境之外，亦推廣產銷履歷認證制度，一旦出現問題，就可以依循線索找出問題根源，及時處理控制，避免疫情擴大。
不論是青蔥或是洋蔥，田間的排水功能都相當重要，因為水氣凝重容易變成病蟲害的溫床，導致蔥葉毀損蟲蛀，因此多數農民仍仰賴殺蟲劑與除草劑。
無毒農業的特色
2010年，蔥農遵循「無毒農業」方式種植洋蔥，不施用除草劑、殺菌劑與化學肥料的洋蔥，並且針對作物品種青蔥，需稍加改良耕種方式：
- 高畦大行距：把畦做高以利排水、加大行距保持通風，降低濕氣聚集引起的病蟲害問題。
- 黑豆取代化肥：不藉由一直施肥的方式催生洋蔥，從10月育苗至隔年4月採收，會比慣行農法種洋蔥晚約一個月收成。
- 不使用殺蟲劑與除草劑：得力於落山風趕走昆蟲，不需除蟲。
收成減少收益卻變大
洋蔥外觀比較小，產量也較少，但是水分飽滿、嗆味帶有層次，鱗莖沉甸。
產量雖然無法與慣行農法種植洋蔥的方式相比，但是市售價格卻上看三倍！甚至在五年後吸引更多蔥農進一步合作，自然形成無毒聚落。
「產銷履歷」(TGAP)從源頭管理
產銷履歷的業者對於種植的作物的種苗來源、土質的管理、灌溉水質檢測、農藥與施肥的規範、病蟲害防治與紀錄、採收分級與冷藏設備等都需按照規定並詳細記錄。
消費者可以透過產品上的條碼，得知生產農民與產地、生產過程、產品驗證項目，包含：水源、土壤、八大重金屬檢測、產品農藥殘留檢測、現場查核…等等，相關資訊。購買來源可追溯的農產品，食安有保障。
「無毒農業」與「有機農業」的差異
「有機農業」主張種植過程不使用基因改造種子、不使用農藥與化學肥料、植物生長調節劑等。
- 防治病蟲草害：透過天敵與微生物驅離害蟲、為蔬果套袋、設置誘殺板惑捕蟲燈等。
- 輪作維持地力：每次耕作前須休耕3年。
- 天然化肥：使用動植物殘渣、家禽或水禽類的糞便作為化肥，滋養田地。
有機認證單位：農糧署授權國際美育自然生態基金會、慈心有機農業發展基金會、台灣寶島有機農業發展協會、台灣省有機農業生產協會及中華有機農業協會等共五個認證單位辦理，各自有設計合格標章。
「無毒農業」建構在「有機農業」的基礎上，種植過程同樣不噴灑農藥與化學肥料。
經過無毒檢驗合格的農產品，縣政府會頒予無毒農業標章認證。消費者可以透過生產履歷，得知產品栽培地點、農戶資訊、土壤與灌溉水源、農業檢測日期和結果，讓消費者購買安心。
- 因此，有機農業與無毒農業的耕種方式近乎雷同，差異只是在於核發認證的單位與細節，相當容易混淆與假冒，消費者需自行查驗，以免購買到不實商品。
名聲所累的假冒產地和偷蔥事件
- 2007年宜蘭縣三星蔥：有鑑於市面上許多品質良莠不齊、卻自號「宜蘭三星蔥」的蔥種流通於市面。三星蔥是產地名，其他非出產自宜蘭三星產地的青蔥不能謊稱，企圖混淆視聽，哄抬售價，三星鄉農民通過生產履歷集團驗證，維護三星蔥的商譽。
- 2019年雲林縣二崙大蔥：二崙鄉生產的大蔥、分蔥（紅蔥頭）亦取得產銷履歷認證。不料蔥的好行情被識貨的竊賊看上，2025年9月無奈的8旬老翁只能攜子連夜守田，甚至與買家提早交易，以防再次被盜。
輪班不再是服務業、公共事業、醫藥業、製造業的行業慣例，青蔥的價值也被眼尖的竊賊盯上了，趁夜黑風高之際偷盜，無奈的蔥農只好開始輪流守夜，避免財產損失。
IPM 作物病蟲害整合性管理（Integrated Pest Management）
近年來，政府開始推動「作物病蟲害整合性管理（Integrated Pest Management，IPM）」提供防治病蟲害解方。
透過「預防」、「監測與評估」和「干預」的方式，設定合理農產損失容許值，也就是經濟臨界值（Economic Threshold, ET），降低農藥使用量的前提之下，找出最佳防治病蟲害防制方式。
- 健康種苗：適地適種、土壤蒸汽消毒、評估施肥種類、時間與用量、透過矽藻土、微生物對種苗進行預措處理，使作物茁壯強健。
- 生物防治：針對地區害蟲族群進行實驗，了解不同區域病蟲害與土壤特性，精準提供用藥處方。
- 物理防治：透過非化學性藥品防治病蟲害，包括設置隔離網罩、果實套袋、性費洛蒙誘蟲燈、植保資材補助等的方法。
- 化學防治：依監測情形合理調整用藥種類，適量釋放捕食性昆蟲天敵防治，不鼓勵過度施肥與噴灑農藥，以減緩對環境傷害、引起病蟲害抗藥性問題，一旦在市場端被驗出農藥殘留超標，就會被處以下架、銷毀，農夫必須慎用農藥。
- 植物醫生培訓：藉由花蓮場技術指導、輔導田間實務、研討會分享、培訓植物醫生為農民服務。
IPM試驗成效：在宜蘭推行的成果，減少了化學農藥使用量10~90%，降低對環境生態的衝擊；經濟效益方面，降低病蟲害防治成本達20%以上，並提高整體產量10～25%，為農友帶來了更高的的收益和利潤。
IPM建立在生態學與環境永續的基礎上，追求經濟利益最大化。IPM最早施行在2014年的宜蘭三星，據官方資料當時試行成效不錯。不過從這十年來青蔥仍持在台灣Dirty Dozen榜上有名的情況來看，普及度仍有待加強。
綜合比較
栽種方式之中，IPM病蟲害整合管理謀求經濟效益最大化、降低農藥肥料的使用量與成本並且對環境友善，是所有農法綜合評分最高者，可惜推廣度不佳。「無毒農業」種植的作物全程不使用農藥化肥、以天然方式驅除病蟲害，定期水質檢驗，農產品提供生產履歷，為消費者食用安全把關，最多農友所採用的工作方式。不論蔥農採取何種方式，都需要再克服大環境之下，提供市場所需的青蔥與洋蔥，結合「智能防災設備」（智慧溫室）硬體架構對天候的防禦最為全方位，通常搭配「有機栽培」或者「無毒農法」耕作經濟作物。